En este caso concreto: "posiciones 2058 y 2032 del gen del ARNr 23S".

Es decir, desde el punto de vista gramatical, el núcleo de este sintagma es 'position xxxx'.

Pero ojo, en la frase en inglés están mezclando posiciones de nucleótidos en un gen (en el caso del ARNr 23S) con posiciones de aminoácidos en una proteína (en el caso de la proteína ribosómica L3). Mirá el resumen y la introducción de este artículo:

http://aac.asm.org/content/55/7/3330.full

Como queda claro en este artículo, las posiciones 2058 y 2032 corresponden a nucleótidos del gen bacteriano, mientras que la posición 148 corresponde a un aminoácido de la proteína ribosómica L3.

Por lo tanto, lo correcto es "posiciones 2058 y 2032 del gen del ARNr 23S y posición 148 de la proteína ribosómica L3" (es decir, en el segundo caso no corresponde hablar del gen).

Si esta es la primera vez que mencionan el ARNr 23S yo es escribiría "ARN ribosómico (ARNr) 23S"; de ahí en más utilizaría la sigla.

Cabe señalar que la forma tradicional en castellano del sufijo de origen griego '-somal' es "-sómico" (autosomal → autosómico, chromosomal → cromosómico, ribosomal → ribosómico, trypanosomal → tripanosómico, etc.).

No obstante, debido a la influencia del inglés se encuentra actualmente con mucha frecuencia la forma "ribosomal".

Saludos cordiales.